In each of these three domains, DNA replication, transcription, and translation all display distinctive features. There are three versions of ribosomal RNAs, and generally three versions of each ribosomal protein, one for each domain of life. These three versions of the protein synthesis apparatus are called the canonical patterns , and the existence of these canonical patterns provides the basis for a definition of the three domains - Bacteria , Archaea , and Eukarya (or Eukaryota ) - of currently existing cells. [22] Instead of relying a single gene such as the small-subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) gene to reconstruct early evolution, or a few genes, scientific effort has shifted to analyzing complete genome sequences. [23] One hypothesis is that the first nucleated cell arose from two distinctly different ancient prokaryotic (non-nucleated) species that had formed a symbiotic relationship with one another to carry out different aspects of metabolism. One partner of this symbiosis is proposed to be a bacterial cell, and the other an archaeal cell. It is postulated that this symbiotic partnership progressed via the cellular fusion of the partners to generate a chimeric or hybrid cell with a membrane bound internal structure that was the forerunner of the nucleus.
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